Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM4

BICRA, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICRAQ9NZM4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC33.26■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
BICRAQ9NZM4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms