Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms