Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX14

NDUFB11, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB11Q9NX14 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms