Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.2 ms