Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms