Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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