Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RSPO3Q9BXY4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms