Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM2Q9BVW6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms