Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms