Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms