Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms