Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms