Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNBD2Q96M20 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNBD2Q96M20 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNBD2Q96M20 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNBD2Q96M20 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNBD2Q96M20 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms