Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms