Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms