Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEIL2Q969S2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms