Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms