Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms