Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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DTX3Q8N9I9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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DTX3Q8N9I9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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DTX3Q8N9I9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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DTX3Q8N9I9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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