Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
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