Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms