Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF493Q6ZR52 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms