Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC141Q6ZP82 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC141Q6ZP82 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC141Q6ZP82 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC141Q6ZP82 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC141Q6ZP82 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC141Q6ZP82 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC141Q6ZP82 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC141Q6ZP82 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC141Q6ZP82 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC141Q6ZP82 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC141Q6ZP82 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC141Q6ZP82 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC141Q6ZP82 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC141Q6ZP82 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC141Q6ZP82 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC141Q6ZP82 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC141Q6ZP82 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms