Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
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