Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC174Q6PII3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms