Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms