Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms