Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms