Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HADHQ16836 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HADHQ16836 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HADHQ16836 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HADHQ16836 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HADHQ16836 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HADHQ16836 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HADHQ16836 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HADHQ16836 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HADHQ16836 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HADHQ16836 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HADHQ16836 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HADHQ16836 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HADHQ16836 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HADHQ16836 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HADHQ16836 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HADHQ16836 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HADHQ16836 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HADHQ16836 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HADHQ16836 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HADHQ16836 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HADHQ16836 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HADHQ16836 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HADHQ16836 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HADHQ16836 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HADHQ16836 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HADHQ16836 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HADHQ16836 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HADHQ16836 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HADHQ16836 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HADHQ16836 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HADHQ16836 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HADHQ16836 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HADHQ16836 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HADHQ16836 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HADHQ16836 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HADHQ16836 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HADHQ16836 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HADHQ16836 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HADHQ16836 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HADHQ16836 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HADHQ16836 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HADHQ16836 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HADHQ16836 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HADHQ16836 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HADHQ16836 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HADHQ16836 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HADHQ16836 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HADHQ16836 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HADHQ16836 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HADHQ16836 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HADHQ16836 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HADHQ16836 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HADHQ16836 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HADHQ16836 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HADHQ16836 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HADHQ16836 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HADHQ16836 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HADHQ16836 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HADHQ16836 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HADHQ16836 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HADHQ16836 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms