Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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