Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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