Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms