Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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