Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNIQ14094 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms