Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
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SHROOM2Q13796 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
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SHROOM2Q13796 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms