Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGEF5Q12774 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGEF5Q12774 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGEF5Q12774 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGEF5Q12774 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGEF5Q12774 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGEF5Q12774 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGEF5Q12774 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGEF5Q12774 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGEF5Q12774 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGEF5Q12774 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGEF5Q12774 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGEF5Q12774 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGEF5Q12774 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGEF5Q12774 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARHGEF5Q12774 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ARHGEF5Q12774 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARHGEF5Q12774 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ARHGEF5Q12774 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms