Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms