Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AL390039.1-201ENST00000399148 611 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms