Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
ERCC6Q03468 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
ERCC6Q03468 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ERCC6Q03468 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ERCC6Q03468 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ERCC6Q03468 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ERCC6Q03468 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ERCC6Q03468 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC30.64■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms