Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIM1P81133 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIM1P81133 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIM1P81133 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIM1P81133 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIM1P81133 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIM1P81133 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIM1P81133 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIM1P81133 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIM1P81133 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIM1P81133 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIM1P81133 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIM1P81133 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIM1P81133 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIM1P81133 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SIM1P81133 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIM1P81133 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SIM1P81133 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIM1P81133 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIM1P81133 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIM1P81133 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIM1P81133 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIM1P81133 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIM1P81133 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms