Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAE1P78406 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAE1P78406 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAE1P78406 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAE1P78406 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAE1P78406 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAE1P78406 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAE1P78406 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAE1P78406 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAE1P78406 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAE1P78406 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAE1P78406 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAE1P78406 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAE1P78406 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAE1P78406 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAE1P78406 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAE1P78406 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAE1P78406 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAE1P78406 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAE1P78406 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAE1P78406 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAE1P78406 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAE1P78406 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAE1P78406 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAE1P78406 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAE1P78406 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAE1P78406 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAE1P78406 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAE1P78406 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAE1P78406 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAE1P78406 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAE1P78406 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAE1P78406 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAE1P78406 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAE1P78406 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAE1P78406 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAE1P78406 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAE1P78406 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAE1P78406 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAE1P78406 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAE1P78406 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAE1P78406 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAE1P78406 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAE1P78406 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAE1P78406 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAE1P78406 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAE1P78406 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAE1P78406 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAE1P78406 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RAE1P78406 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RAE1P78406 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAE1P78406 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAE1P78406 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAE1P78406 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAE1P78406 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAE1P78406 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAE1P78406 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAE1P78406 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAE1P78406 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms