Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms