Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SPCS3P61009 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SPCS3P61009 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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