Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP107P57740 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP107P57740 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP107P57740 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP107P57740 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP107P57740 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP107P57740 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP107P57740 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP107P57740 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP107P57740 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP107P57740 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP107P57740 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP107P57740 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP107P57740 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP107P57740 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP107P57740 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP107P57740 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP107P57740 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP107P57740 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP107P57740 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP107P57740 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP107P57740 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP107P57740 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP107P57740 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP107P57740 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP107P57740 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP107P57740 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP107P57740 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP107P57740 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP107P57740 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP107P57740 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP107P57740 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP107P57740 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP107P57740 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP107P57740 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP107P57740 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP107P57740 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP107P57740 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP107P57740 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP107P57740 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP107P57740 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP107P57740 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP107P57740 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP107P57740 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP107P57740 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP107P57740 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP107P57740 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP107P57740 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP107P57740 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP107P57740 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP107P57740 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP107P57740 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP107P57740 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP107P57740 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP107P57740 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP107P57740 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP107P57740 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP107P57740 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP107P57740 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP107P57740 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP107P57740 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms