Protein–RNA interactions for Protein: P52907

CAPZA1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA1P52907 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA1P52907 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms