Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms