Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB28P51157 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB28P51157 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB28P51157 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB28P51157 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB28P51157 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB28P51157 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB28P51157 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB28P51157 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB28P51157 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB28P51157 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB28P51157 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB28P51157 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB28P51157 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB28P51157 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB28P51157 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB28P51157 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB28P51157 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB28P51157 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB28P51157 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB28P51157 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB28P51157 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB28P51157 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB28P51157 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB28P51157 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB28P51157 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB28P51157 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB28P51157 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB28P51157 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB28P51157 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB28P51157 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB28P51157 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB28P51157 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB28P51157 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB28P51157 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB28P51157 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB28P51157 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB28P51157 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB28P51157 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB28P51157 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB28P51157 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB28P51157 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB28P51157 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB28P51157 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB28P51157 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB28P51157 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB28P51157 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB28P51157 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB28P51157 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB28P51157 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB28P51157 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB28P51157 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB28P51157 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB28P51157 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB28P51157 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB28P51157 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB28P51157 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB28P51157 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB28P51157 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB28P51157 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB28P51157 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB28P51157 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB28P51157 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB28P51157 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB28P51157 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB28P51157 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB28P51157 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB28P51157 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB28P51157 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB28P51157 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB28P51157 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB28P51157 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB28P51157 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB28P51157 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB28P51157 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB28P51157 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB28P51157 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB28P51157 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB28P51157 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB28P51157 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB28P51157 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB28P51157 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB28P51157 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB28P51157 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB28P51157 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB28P51157 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB28P51157 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB28P51157 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB28P51157 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB28P51157 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB28P51157 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB28P51157 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB28P51157 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB28P51157 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB28P51157 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB28P51157 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB28P51157 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB28P51157 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB28P51157 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB28P51157 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms