Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAMP50895 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAMP50895 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAMP50895 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAMP50895 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAMP50895 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAMP50895 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAMP50895 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAMP50895 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAMP50895 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAMP50895 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAMP50895 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAMP50895 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAMP50895 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAMP50895 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAMP50895 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAMP50895 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAMP50895 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAMP50895 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAMP50895 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAMP50895 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAMP50895 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAMP50895 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAMP50895 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAMP50895 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAMP50895 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAMP50895 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAMP50895 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAMP50895 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAMP50895 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAMP50895 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAMP50895 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAMP50895 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAMP50895 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAMP50895 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAMP50895 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAMP50895 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAMP50895 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAMP50895 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAMP50895 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAMP50895 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAMP50895 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAMP50895 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCAMP50895 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCAMP50895 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCAMP50895 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCAMP50895 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCAMP50895 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCAMP50895 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCAMP50895 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCAMP50895 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCAMP50895 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCAMP50895 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCAMP50895 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCAMP50895 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCAMP50895 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCAMP50895 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCAMP50895 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCAMP50895 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCAMP50895 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCAMP50895 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCAMP50895 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCAMP50895 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCAMP50895 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCAMP50895 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCAMP50895 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCAMP50895 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCAMP50895 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCAMP50895 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCAMP50895 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCAMP50895 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCAMP50895 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCAMP50895 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCAMP50895 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCAMP50895 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCAMP50895 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCAMP50895 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCAMP50895 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCAMP50895 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCAMP50895 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCAMP50895 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCAMP50895 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCAMP50895 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BCAMP50895 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BCAMP50895 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCAMP50895 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCAMP50895 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BCAMP50895 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCAMP50895 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCAMP50895 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BCAMP50895 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCAMP50895 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCAMP50895 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCAMP50895 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCAMP50895 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BCAMP50895 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
BCAMP50895 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BCAMP50895 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BCAMP50895 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BCAMP50895 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms