Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms