Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UTRNP46939 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UTRNP46939 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UTRNP46939 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UTRNP46939 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UTRNP46939 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UTRNP46939 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UTRNP46939 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UTRNP46939 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UTRNP46939 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UTRNP46939 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UTRNP46939 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UTRNP46939 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UTRNP46939 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UTRNP46939 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UTRNP46939 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UTRNP46939 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UTRNP46939 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UTRNP46939 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UTRNP46939 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UTRNP46939 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTRNP46939 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTRNP46939 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTRNP46939 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTRNP46939 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTRNP46939 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UTRNP46939 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UTRNP46939 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTRNP46939 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTRNP46939 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UTRNP46939 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTRNP46939 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTRNP46939 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTRNP46939 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTRNP46939 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTRNP46939 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTRNP46939 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTRNP46939 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UTRNP46939 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTRNP46939 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTRNP46939 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTRNP46939 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTRNP46939 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UTRNP46939 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UTRNP46939 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UTRNP46939 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UTRNP46939 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UTRNP46939 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UTRNP46939 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UTRNP46939 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UTRNP46939 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UTRNP46939 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UTRNP46939 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UTRNP46939 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UTRNP46939 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UTRNP46939 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UTRNP46939 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UTRNP46939 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UTRNP46939 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UTRNP46939 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UTRNP46939 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UTRNP46939 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UTRNP46939 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UTRNP46939 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UTRNP46939 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UTRNP46939 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UTRNP46939 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTRNP46939 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UTRNP46939 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTRNP46939 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UTRNP46939 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTRNP46939 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UTRNP46939 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTRNP46939 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTRNP46939 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTRNP46939 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTRNP46939 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTRNP46939 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTRNP46939 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTRNP46939 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UTRNP46939 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTRNP46939 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTRNP46939 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTRNP46939 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UTRNP46939 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UTRNP46939 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTRNP46939 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTRNP46939 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTRNP46939 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UTRNP46939 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTRNP46939 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTRNP46939 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UTRNP46939 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTRNP46939 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTRNP46939 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTRNP46939 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UTRNP46939 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTRNP46939 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTRNP46939 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTRNP46939 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms